Các địa phương giao Chi cục BVTV có phương án bố trí kho lưu chứa và tiếp nhận các loại thuốc BVTV bị các cơ quan chức năng thu giữ trong quá trình thanh tra, kiểm tra (kể cả thuốc vô chủ), đồng thời xây dựng kế hoạch để xử lý, tiêu hủy.
Bộ NN&PTNT cho biết, theo phản ánh của các đơn vị thuộc Bộ Công thương và Bộ Tài chính, khó khăn lớn nhất hiện nay là tại các địa phương chưa có đơn vị đầu mối chịu trách nhiệm tiếp nhận thuốc BVTV bị thu giữ để lưu chứa và tiêu hủy.