Theo đó, chế độ ưu tiên đối với cán bộ, công chức thuộc kiểm toán Nhà nước được sửa đổi là hằng năm, căn cứ vào kết quả thực hiện kiến nghị kiểm toán, Kiểm toán Nhà nước được trích 5% (quy định cũ là 2%) số tiền do Kiểm toán Nhà nước phát hiện và kiến nghị, bao gồm các khoản tăng thu ngân sách Nhà nước về thuế, phí, lệ phí và các khoản thu khác đã thực nộp vào ngân sách Nhà nước; các khoản đã thực chi ngân sách sai chế độ đã nộp lại ngân sách Nhà nước; các khoản đã thực chi ngân sách sai chế độ đã xử lý giảm chi, giảm thanh toán vào ngân sách năm sau.
Số kinh phí 5% này được sử dụng cho chi khuyến khích, thưởng cho cán bộ, công chức và người lao động của Kiểm toán Nhà nước không vượt quá 0,8 lần lương cấp bậc, phụ cấp chức vụ, vượt khung và phụ cấp nghề nghiệp.