Theo đó, trong giai đoạn từ năm 2013-2014, Transerco cơ cấu lại vốn đầu tư của 3 công ty thành viên. Cụ thể, thoái một phần vốn Nhà nước còn dưới 25% vốn điều lệ Công ty CP Xăng dầu chất đốt Hà Nội; thoái toàn bộ vốn Nhà nước tại Công ty CP Xây dựng giao thông đô thị Hà Nội và Công ty Sakura Hanoi Plaza.Tương tự, giai đoạn từ năm 2014-2015, sẽ tiếp tục thoái vốn Nhà nước tại hàng loạt đơn vị như Công ty CP Xe khách Hà Nội; Công ty CP Đóng tàu Hà Nội...
Việc tái cơ cấu nhằm bảo đảm cho Transerco có cơ cấu hợp lý, tập trung vào lĩnh vực kinh doanh vận tải hành khách và các dịch vụ hạ tầng công cộng, sản phẩm dịch vụ công ích phục vụ xã hội...
