Tuy nhiên, nhiều địa phương vẫn chưa đủ điều kiện triển khai môn học này do khó khăn về cách chọn lọc tư liệu, lấy ví dụ những vụ việc tham nhũng trong đời sống kinh tế-xã hội để phục vụ giảng dạy cho học sinh sao cho phù hợp với lứa tuổi hay quá tải trong việc lồng ghép vào môn Giáo dục công dân, đội ngũ giáo viên không được đào tạo chuyên môn pháp luật… Để giải quyết những khó khăn trước mắt, Bộ GD-ĐT đã tổ chức xây dựng 6 bài giảng E-leaning môn Giáo dục công dân có lồng ghép, tích hợp nội dung phòng chống tham nhũng đưa lên mạng để các nhà trường tham khảo.