Bên cạnh đó, có 2/3 số doanh nghiệp đầu tư ứng dụng CNTT nhưng chủ yếu cho phần cứng, trong khi ứng dụng phần mềm rất hạn chế. Ứng dụng phần mềm phổ biến nhất là: email, các ứng dụng cảnh báo an toàn, diệt virus, quản lý văn bản, quản lý nhân sự, kế toán. Hai ứng dụng quan trọng nhất mang lại hiệu quả cho việc nâng cao năng lực cạnh tranh thì lại được ứng dụng thấp nhất. Cụ thể là ứng dụng quản trị khách hàng (CRM) chỉ có 11% và quản trị tổng thể nguồn lực (ERP) mới có 28% doanh nghiệp triển khai. Đầu tư cho đào tạo CNTT chỉ chiếm một khoản chi phí khiêm tốn, khoảng 16 tỷ đồng.
Cuộc khảo sát tình hình ứng dụng CNTT của 19/32 doanh nghiệp là tập đoàn, tổng công ty nhà nước, ngân hàng nhà nước năm 2012 cũng cho thấy nhận thức của các doanh nghiệp về vai trò của CNTT ngày càng tăng.
